Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccbe1Q3MI99 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccbe1Q3MI99 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccbe1Q3MI99 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms