Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Riiad1Q3KNY5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Riiad1Q3KNY5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms