Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
H2-M3Q31093 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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H2-M3Q31093 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2-M3Q31093 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2-M3Q31093 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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H2-M3Q31093 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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