Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KncnQ307W7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KncnQ307W7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms