Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim71Q1PSW8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim71Q1PSW8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim71Q1PSW8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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