Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sap25Q1EHW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sap25Q1EHW4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sap25Q1EHW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms