Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tdrd9Q14BI7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tdrd9Q14BI7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tdrd9Q14BI7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tdrd9Q14BI7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms