Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spatc1Q148B6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Spatc1Q148B6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Spatc1Q148B6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Spatc1Q148B6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Spatc1Q148B6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spatc1Q148B6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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