Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cpne7Q0VE82 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne7Q0VE82 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms