Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Itgb8Q0VBD0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb8Q0VBD0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb8Q0VBD0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms