Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Spata18Q0P557 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spata18Q0P557 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spata18Q0P557 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spata18Q0P557 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spata18Q0P557 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spata18Q0P557 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spata18Q0P557 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms