Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r181Q0P547 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vmn1r181Q0P547 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r181Q0P547 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms