Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubxn2bQ0KL01 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn2bQ0KL01 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn2bQ0KL01 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms