Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ssrp1Q08943 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssrp1Q08943 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssrp1Q08943 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms