Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tgm3Q08189 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tgm3Q08189 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tgm3Q08189 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms