Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn2Q08093 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cnn2Q08093 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cnn2Q08093 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms