Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Col9a2Q07643 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col9a2Q07643 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms