Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx4Q07424 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdx4Q07424 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms