Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nfe2Q07279 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nfe2Q07279 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nfe2Q07279 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms