Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf3Q07104 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gdf3Q07104 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gdf3Q07104 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms