Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3bp2Q06649 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp2Q06649 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp2Q06649 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms