Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnal1Q05A62 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dnal1Q05A62 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnal1Q05A62 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms