Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sox10Q04888 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sox10Q04888 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sox10Q04888 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms