Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Top1Q04750 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1Q04750 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1Q04750 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1Q04750 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top1Q04750 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top1Q04750 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms