Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Emx2Q04744 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Emx2Q04744 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Emx2Q04744 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Emx2Q04744 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms