Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk16Q04735 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk16Q04735 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk16Q04735 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms