Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcad1Q04692 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcad1Q04692 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcad1Q04692 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms