Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cxcr5Q04683 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cxcr5Q04683 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms