Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RelaQ04207 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RelaQ04207 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RelaQ04207 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RelaQ04207 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RelaQ04207 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RelaQ04207 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms