Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scg2Q03517 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scg2Q03517 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scg2Q03517 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms