Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Msx2Q03358 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Msx2Q03358 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Msx2Q03358 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms