Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfiaQ02780 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfiaQ02780 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfiaQ02780 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms