Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GscQ02591 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GscQ02591 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GscQ02591 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GscQ02591 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GscQ02591 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GscQ02591 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GscQ02591 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GscQ02591 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GscQ02591 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GscQ02591 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GscQ02591 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GscQ02591 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GscQ02591 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GscQ02591 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GscQ02591 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GscQ02591 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GscQ02591 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GscQ02591 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GscQ02591 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GscQ02591 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GscQ02591 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GscQ02591 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GscQ02591 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GscQ02591 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GscQ02591 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GscQ02591 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GscQ02591 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GscQ02591 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GscQ02591 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GscQ02591 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GscQ02591 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GscQ02591 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GscQ02591 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GscQ02591 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GscQ02591 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GscQ02591 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GscQ02591 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GscQ02591 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GscQ02591 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GscQ02591 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GscQ02591 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GscQ02591 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GscQ02591 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GscQ02591 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GscQ02591 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GscQ02591 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GscQ02591 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GscQ02591 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GscQ02591 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GscQ02591 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GscQ02591 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GscQ02591 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GscQ02591 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GscQ02591 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GscQ02591 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GscQ02591 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GscQ02591 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GscQ02591 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GscQ02591 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GscQ02591 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GscQ02591 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GscQ02591 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GscQ02591 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GscQ02591 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GscQ02591 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GscQ02591 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GscQ02591 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GscQ02591 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GscQ02591 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GscQ02591 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GscQ02591 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GscQ02591 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GscQ02591 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GscQ02591 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GscQ02591 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GscQ02591 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GscQ02591 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GscQ02591 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GscQ02591 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GscQ02591 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GscQ02591 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GscQ02591 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GscQ02591 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GscQ02591 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GscQ02591 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GscQ02591 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms