Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnb1Q02248 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnb1Q02248 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms