Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RykQ01887 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RykQ01887 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RykQ01887 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RykQ01887 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RykQ01887 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RykQ01887 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RykQ01887 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RykQ01887 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RykQ01887 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RykQ01887 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RykQ01887 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RykQ01887 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RykQ01887 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RykQ01887 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RykQ01887 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RykQ01887 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RykQ01887 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RykQ01887 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RykQ01887 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RykQ01887 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RykQ01887 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RykQ01887 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RykQ01887 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RykQ01887 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RykQ01887 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RykQ01887 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RykQ01887 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RykQ01887 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RykQ01887 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RykQ01887 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RykQ01887 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RykQ01887 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RykQ01887 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RykQ01887 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RykQ01887 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RykQ01887 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RykQ01887 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RykQ01887 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RykQ01887 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RykQ01887 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RykQ01887 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RykQ01887 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RykQ01887 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RykQ01887 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RykQ01887 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RykQ01887 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RykQ01887 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RykQ01887 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RykQ01887 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RykQ01887 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RykQ01887 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RykQ01887 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RykQ01887 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RykQ01887 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RykQ01887 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RykQ01887 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RykQ01887 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RykQ01887 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RykQ01887 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RykQ01887 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms