Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gbp1Q01514 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbp1Q01514 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbp1Q01514 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms