Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col1a2Q01149 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col1a2Q01149 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col1a2Q01149 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms