Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pde1bQ01065 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde1bQ01065 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pde1bQ01065 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms