Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GabpaQ00422 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GabpaQ00422 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GabpaQ00422 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms