Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gbp10Q000W5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp10Q000W5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms