Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp11aP98197 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp11aP98197 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp11aP98197 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms