Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apba2P98084 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apba2P98084 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apba2P98084 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apba2P98084 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apba2P98084 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba2P98084 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apba2P98084 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apba2P98084 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apba2P98084 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apba2P98084 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apba2P98084 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apba2P98084 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apba2P98084 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apba2P98084 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apba2P98084 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms