Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfdP97946 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VegfdP97946 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfdP97946 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfdP97946 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfdP97946 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfdP97946 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfdP97946 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VegfdP97946 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfdP97946 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms