Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ppp4cP97470 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ppp4cP97470 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ppp4cP97470 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms