Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1b3P97370 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1b3P97370 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms