Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43cP86449 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim43cP86449 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43cP86449 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms