Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cbx1P83917 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cbx1P83917 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cbx1P83917 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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