Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gfi1P70338 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gfi1P70338 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gfi1P70338 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms