Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tbx6P70327 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tbx6P70327 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms