Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pitx1P70314 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pitx1P70314 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pitx1P70314 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms